Hier ist eine Einspielung meines letzten Orgellehrers Wolfgang Reisinger an der Hartwig-Späth-Orgel der Wiener Jesuitenkirche, die ich empfehlen kann:
Fantasie G-Dur BWV 542 Wolfgang Reisinger

Auch Bernard Focroulle´s Einspielung an der Dreifaltigkeitsorgel der Basilika Ottobeuren gefällt mir sehr gut, v.a. klanglich:
Fantasie G-Dur BWV 542 Bernard Foucroulle
Etwas eigenwillig an dieser Interpretation finde ich, dass er den gesamten Schlussteil konsequent mit sanfter Flötenmischung durchspielt und auch beim Finale nicht aufregistriert bzw. auf das Hauptwerk wechselt, aber okay, warum nicht.
Interessantes Detail: Diese Orgel ist ca. einen Halbton tiefer gestimmt als heute üblich, man hört Bach´s Piece d´orgue hier also eigentlich in Fis-Dur anstatt G-Dur.

Natürlich habe ich dieses Stück auch gespielt, ein paarmal übrigens auch als Postludium nach der Christmette, einmal auch in der Osternacht.
Hier ist eine Live-Aufnahme von einem Konzert am 19.04.2009 an der Walcker-Orgel der Pfarr- und Wallfahrtskirche Pottenstein in Niederösterreich:
Fantasie G-Dur BWV 542 Roman Jungegger

Und natürlich ist jede Interpretation Geschmacksache, es lebe die künstlerische Freiheit jedes Organisten.
Es kommt immer auch auf das Instrument an, nicht alle Registrierungen klingen auf allen Orgeln gleich gut.
Hör´dir viele, verschiedene Interpretationen an, übe das Stück mit verschiedenen Registrierungen, ev. auch mit verschiedenen Intonationen und dann finde deinen eigenen, ganz persönlichen Weg !